Студенты Ниндзя Академии получают силы рейнджеров Ниндзя Шторма. Шестеро рейнджеров совсместными усилиями должны остановить армию пришельца Лотора.

Несколько лет назад на уединенном острове в океане произошла катастрофа, и он погрузился на дно. С острова успел убежать только один человек - молодой доктор палеонтологии Томми Оливер. На острове проводился необычный эксперимент, однако что-то пошло не так, и неожиданным творением генетики